故事背景设定为20世纪90年代的半架空世界，国际佣兵化军事组织“秘银”与国际恐怖组织展开着战斗，而在这过程中身为秘银特工的少年相良宗介，与他任务中的保护对象——高中生少女千鸟要相遇并展开了一段冒险之旅。

这是一个美苏两个超级大国仍然在明争暗斗的时代，分成东西两大阵营的人类虽然没有进行大规模的军事行动，但是在不为人知的背后世界里，各国的情报人员正进行着残酷异常的间谍战。相良宗介中士是神秘的国际组织米斯利尔特殊部队成员，专门在世界各地即将发生战争或武装冲突的地区从事组织下达的秘密任务，化解危机。这一次宗介接到了一个在日本当地的任务，要他化装成高中生潜入都立阵代高校，去保护一位16岁的女高中生千鸟香奈芽。这位蓝发少女似乎和普通的女高中生没有什么两样，但却成为各国间谍秘密争夺的目标。为了保护千鸟，宗介驾驶机动战士"Arm Slave"与其它神秘组织对峙。使得都立阵代高校成了一块危险之地，校内随时发生疯

幼年遭遇飞机事故，因而在阿富汗长大的男主角相良宗介中士是神秘的国际组织秘银特殊部队成员，专门在世界各地即将发生战争或武装冲突的地区执行组织下达的秘密任务，对抗恐怖份子，缓救人质，化解各式各样危机。 而宗介最新的任务要尽快前往日本，任务内容为伪装成高中生潜入都立阵代高校，去保护一位16岁的女高中生千鸟要。这位少女似乎和普通的女高中生没有什么两样，但不知什么原因却成为各国间谍秘密争夺的目标。为了保护千鸟，宗介驾驶着80年代末才在战场中出现的新式兵器--强袭机兵“Arm Slave”与其他神秘组织对峙。

幼年遭遇飞机事故，因而在阿富汗长大的男主角相良宗介中士是神秘的国际组织秘银特殊部队成员，专门在世界各地即将发生战争或武装冲突的地区执行组织下达的秘密任务，对抗恐怖份子，缓救人质，化解各式各样危机。而宗介最新的任务要尽快前往日本，任务内容为伪装成高中生潜入都立阵代高校，去保护一位16岁的女高中生千鸟要。这位少女似乎和普通的女高中生没有什么两样，但不知什么原因却成为各国间谍秘密争夺的目标。为了保护千鸟，宗介驾驶着80年代末才在战场中出现的新式兵器--强袭机兵“Arm Slave”与其他神秘组织对峙。

宗介与高卢决战之后，宗介继续担任千鸟的贴身保镖，可是他的性格无疑又为校园的安全和世界的和平蒙上了层层阴影。 作为学生会副主席的千鸟当然不能对此袖手旁观，在宗介作出一些危险的事情之后，一场痛打是免不了的……

【本字幕由诸神双语字幕组协力译制】在20世纪,世界格局比较稳定的时候,各大国都想增强自己的军事力量,从而称霸世界.而Whisper[耳语者]这种特殊的人类,自从出生开始就拥有特殊的能力,不用学习也能知道超越当时科技几十年的被称为黑科技的高科技手段.为了保护世界格局的稳定,神秘组织Mithril[米斯利尔]派出了相良中士等三人去保护一名已知的Whisper[耳语者],即千鸟要。其中相良中士装成转校生随时跟踪保护,由于长期处于军队的生活,完全没有普通高中生的生活常识的相良中士在学校里闹了不少笑话.在学校期间也发生了不少恐怖的事情,如苏联为绑架香奈制造的劫机事件等.宗介和千鸟之间也因为发生的各种事件产生了特殊的感情.

　　做料理的加里宁？看动画片的克鲁佐？这些正剧中无法表现出来的人物的另一面，在这部短篇中将一一呈现。故事以泰莎舰长的日记作为铺垫，从更私人的角度描写泰莎对舰内众人的看法，以及对宗介的感情。当然，整个故事的基调还是轻松活泼的，一些经典搞笑的段子也都会出现在OVA动画中。

打倒了敌人“汞合金”的九龙、盖茨等强敌，恢复了以往和平日常的“阵代高中”。但，这样的日子并未延续多久……。持续失态的“汞合金”开始正式向相良宗介等人发动袭击。世界各地的“秘银”基地遭到强袭！泰莎率领的Tuatha de Danaan所容身的“美利达岛”也遭到大量导弹、强袭机兵的攻击。另一方面，魔手也正在逼近日本的宗介与要！！宗介、要、泰莎等人，再度面临试炼！！！

为了后述的全金动画第4作『Invisible Victory』，由千明导演担任总指挥，使用2010年代下的最新技术对第1期动画进行了改进，自2017年11月起，以『TV动画「全金属狂潮！」导演剪辑版』为题的三部曲总集篇在两处东京·一处大阪的影院进行了各自为期一周的期间限定上映